Identificación de dominios ultraconservados de riboswitches en los genomas de Oryza sativa, Chlamydomonas reinhardtii, Volvox carteri, Arabidopsis thaliana y Scenedesmus obliquus para la comprensión de la modulación genética de la proteína D1

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Autores

Naranjo Quiroga, Julieth Camila

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Resumen

Regulatory elements of gene expression, such as riboswitches, are regions of the stable mRNAs that allow the expression of some genes to be modulated in response to presence of metabolites or other types of small molecules, thus being the regulation independent of promoters in their transcripts. Given this potential response to metabolites, are a target of interest to study their characteristics and predictions in new genes with bioinformatic techniques. For this, in the following work it is intended perform a search for possible and conserved structures of the psbA gene with potential for modulate its expression of photosystem II protein D1. They were used under this work model species Oryza sativa, Chlamydomonas reinhardtii, Volvox carteri, Arabidopsis thaliana, Scenedesmus obliquus and other related species.

Descripción

Los elementos reguladores de expresión génica como los riboswitches, son regiones del ARNm estables que permiten modular la expresión de algunos genes como respuesta al presencia de metabolitos u otro tipo de moléculas pequeñas, siendo así la regulación independiente de promotores en sus transcritos. Dado este potencial de respuesta a los metabolitos, son un blanco de interés para estudiar sus características y predicciones en nuevos genes con técnicas bioinformáticas. Para ello, en el siguiente trabajo se pretende realizar una búsqueda de posibles y estructuras conservadas del gen psbA con potencial de modular su expresión de la proteína D1 del fotosistema II. Se utilizaron bajo este trabajo especies modelo Oryza sativa, Chlamydomonas reinhardtii,Volvox carteri, Arabidopsis thaliana, Scenedesmus obliquus y otras especies relacionadas.

Palabras clave

Riboswitch, Fotosíntesis, Proteínas, Biología sintética, Bioinformática, Metabolismo, Evolución

Materias

Licenciatura en Biología - Tesis y disertaciones académicas , Biología , Genética vegetal , Proteínas vegetales

Citación