Diseño racional de fármacos del proteosoma para mieloma múltiple

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Resumen

The objective of this research is to theoretically and rationally design a new drug for a molecular target such as the proteasome by means of computational methods for chemotherapy treatment in patients with Multiple Myeloma (MM). To achieve this, a protein provided by the Protein Data Bank (6XMJ) was used and all the drugs from the family of proteasome inhibitors that are commercial or in preclinical and clinical phases were analyzed, including Bortezomib, Ixazomib, Carfilzomib, Oprozomib, Marizomib and Delanzomib. Each of them acted as a ligand and had an interaction between the β5 subunit of the proteasome. Different software such as ChemSketch, Avogadro, Autodock Vina, Discovery Studio and PreADMET were used to determine variables such as interactions (SAR), molecular docking and toxicity. After this, Delanzomib was chosen as the leading drug, which would be structurally modified, respecting the pharmacophore and modifying the auxophore, where the pertinent isosteric changes were made. 21 compounds were analyzed through computational methods and a new drug prototype called INA-216 was generated whose functional group is an amide and achieved interaction with 14 amino acids of the proteasome and had much better toxicity values ​​compared to Delanzomib. INA-216 may function as a potential drug for the treatment of MM as it was determined that inhibition of the proteasome results in the stabilization of signaling pathways that are affected by MM, which may have effects on decreased proliferation. cell and increased apoptosis.

Descripción

La presente investigación tiene como objetivo diseñar de manera teórica y racionalmente un nuevo fármaco para un blanco molecular como el proteosoma por medio de métodos computaciones para el tratamiento de quimioterapia en pacientes con Mieloma Múltiple (MM). Para lograrlo se utilizó una proteína facilitada por Protein Data Bank (6XMJ) y se analizaron todos los fármacos de la familia de los inhibidores de proteosoma que se encuentran comerciales o en fases preclínicas y clínicas, entre ellas el Bortezomib, Ixazomib, Carfilzomib, Oprozomib, Marizomib y Delanzomib. Cada una de ellas actuó como ligando y tuvo una interacción entre la subunidad β5 del proteosoma. Se utilizaron diferentes softwares como ChemSketch, Avogadro, Autodock Vina, Discovey Studio y PreADMET para determinar variables como, interacciones (SAR), acoplamiento molecular y toxicidad. Finalizado esto, se eligió el Delanzomib como el fármaco líder el cual se modificaría estructuralmente, respetando el farmacóforo y modificando el auxóforo, en donde se realizaron los cambios isostéricos pertinentes. Se analizaron 21 compuestos por medio de métodos computaciones y se generó un nuevo prototipo de fármaco denominado INA-216 cuyo grupo funcional es una amida y logro la interacción con 14 aminoácidos del proteosoma y tuvo valores de toxicidad mucho mejores comparados con el Delanzomib. INA-216 puede funcionar como un posible fármaco para el tratamiento del MM pues se determinó que la inhibición del proteasoma da como resultado la estabilización de vías de señalización que se ven afectadas por el MM, lo que puede tener efectos en la disminución de la proliferación celular y el aumento de la apoptosis.

Palabras clave

Fármaco, Proteosoma, Mieloma múltiple, Métodos computacionales, Inhibidores del proteosoma, Software, Tratamiento, Blanco molecular, Farmacóforo, Auxóforo, Interacción, Proliferación celular, Apoptosis

Materias

Licenciatura en Química -- Tesis y disertaciones académicas , Diseño racional de fármacos y mieloma múltiple , Docking molecular e inhibidores del proteosoma , Quimioinformática y farmacología computacional

Citación