Los códigos de barra de ADN como herramienta en la identificación de las especies del género Micropholis (Griseb.) Pierre ((Sapotaceae)

dc.contributor.advisorCortés Ballén, Rocíospa
dc.contributor.advisorRichardson, Jamesspa
dc.contributor.authorSánchez Callejas, Shirley Dayanaspa
dc.date.accessioned2016-11-01T13:16:11Z
dc.date.available2016-11-01T13:16:11Z
dc.date.created2016-10-20spa
dc.descriptionEl género Micropholis (Sapotaceae) es diverso y ecológicamente importante en los bosques húmedos de tierras bajas del Neotrópico. En general, las especies son difíciles de identificar en ausencia de caracteres reproductivos y en estados juveniles. Por consiguiente, se podría subestimar la biodiversidad de los bosques donde crecen, lo que a su vez podría impedir tomar decisiones acertadas en cuanto al manejo, uso y conservación de estos bosques. Actualmente, existen técnicas alternativas que permiten identificar las especies con base en caracteres moleculares usando los códigos de barra de ADN. Nuestro objetivo fue evaluar la capacidad de los marcadores moleculares ITS2, matK y rbcL en la identificación de 22 especies de Micropholis que tienen una distribución pantropical. Los análisis de Neighbor-Joining, máxima parsimonia e inferencia bayesiana mostraron que el marcador molecular con mejores resultados fue ITS2, con un 70% de eficiencia, en donde 15 de las 20 especies se pudieron identificar con esta región nuclear. Los dos marcadores del cloroplasto no presentaron resultados óptimos para la determinación de las especies del género, por lo que se propone a ITS2 como potencial código de barras para la identificación de las especies de Micropholis.spa
dc.description.abstractThe genus Micropholis (Sapotaceae) is diverse and ecologically important in lowland tropical wet neotropical forests. In general, species are difficult to identify in the absence of reproductive traits and in juvenile stages. As a result we may underestimate the biodiversity of the forests where these species grow that is an impediment to forest management and conservation decision making. Alternative techniques to identify species are based on molecular characters using DNA barcoding. This study assessed the ability of molecular markers ITS2, matK and rbcL in differentiating species of the genus Micropholis. Neighbor-Joining analysis, maximum parsimony and Bayesian inference showed that ITS2 was the best marker for species identification with an efficiency of 70% in discriminating species, with sufficient interspecific and intraspecific divergence to identify 15 of the 20 species used in the analysis. The two additional chloroplast markers did not improve species determination. Thus, we propose ITS2 as a potential barcode marker for identifying species in Micropholis.spa
dc.description.sponsorshipRoyal Botanic Garden Edinburghspa
dc.format.mimetypepdfspa
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11349/4135
dc.language.isospaspa
dc.rightsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional*
dc.rights.accesoAbierto (Texto Completo)spa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectBiodiversidadspa
dc.subjectDistancia genéticaspa
dc.subjectITS2spa
dc.subjectMatKspa
dc.subjectTaxonomíaspa
dc.subjectRbcLspa
dc.subject.keywordBiodiversityspa
dc.subject.keywordGenetic distancespa
dc.subject.keywordITS2spa
dc.subject.keywordMatKspa
dc.subject.keywordTaxonomyspa
dc.subject.keywordRbcLspa
dc.subject.lembMaestría en Manejo, Uso y Conservación del Bosque - Tesis y disertaciones académicasspa
dc.subject.lembHuellas de plantas por ADNspa
dc.subject.lembBosques húmedosspa
dc.subject.lembTaxonomía vegetalspa
dc.subject.lembMaestría en Manejo, Uso y Conservación del Bosque – Tesis y Disertaciones Académicas Madera -Clasificación Árboles maderables -Clasificación Bosques - Diversidad biológicaspa
dc.titleLos códigos de barra de ADN como herramienta en la identificación de las especies del género Micropholis (Griseb.) Pierre ((Sapotaceae)spa
dc.title.titleenglishDna barcoding as a tool for identification of species of the Genus Micropholis (Griseb.) Pierre (SAPOTACEAE)spa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_bdccspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/masterThesisspa

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