Caracterización de la diversidad genética de las especies de coca cultivadas en Colombia
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2025-04-01
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Universidad Distrital Francisco José de Caldas
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Arce Lozano, Rodolfo Elías (2025). Caracterización de la diversidad genética de las especies de coca cultivadas en Colombia. Universidad Distrital Francisco José de Caldas. https://hdl.handle.net/11349/103502
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Resumen
Coca crops in Colombia have undergone selection processes, yet their genetic diversity remains poorly understood. This study assessed the genetic diversity and structure of three cultivated Erythroxylum varieties using nuclear and chloroplast microsatellites, based on samples from the 2012 SIMCI-UNODC survey. A total of 70 individuals were analyzed, identifying 333 nuclear and 318 chloroplast alleles. Results revealed high genetic diversity, with E. coca var. coca showing the highest variability. PERMANOVA analysis detected significant differences among varieties (p < 0.01), although with low explained variation (R² = 0.06–0.15), indicating that most variability occurs within varieties. Low FST values and STRUCTURE analysis (K = 2) revealed genetic admixture and gene flow among varieties. Overall, cultivated coca varieties form an interconnected genetic system shaped by human management.
Descripción
Los cultivos de coca en Colombia han sido sometidos a procesos de selección, pero su diversidad genética es poco conocida. Este estudio evaluó la diversidad y la estructura genética de tres variedades de Erythroxylum mediante microsatélites nucleares y cloroplásticos, a partir de muestras del monitoreo del proyecto SIMCI-UNODC de 2012. Se analizaron 70 individuos, identificándose 333 alelos nucleares y 318 alelos cloroplásticos. Los resultados evidenciaron altos niveles de diversidad genética, con mayor variabilidad en E. coca var. coca. El análisis PERMANOVA detectó diferencias significativas entre variedades (p < 0.01), aunque con baja variación explicada (R² = 0.06–0.15), indicando que la mayor diversidad se concentra dentro de las variedades. Los valores bajos de FST y el análisis con STRUCTURE (K = 2) evidenciaron mezcla genética y flujo génico entre variedades. En conjunto, las cocas cultivadas conforman un sistema genético interconectado influenciado por el manejo antrópico.