Show simple item record

dc.contributor.advisorRojas Barbosa, Sergio Alejandrospa
dc.creatorEscobar Hernandez, Gustavo Orlandospa
dc.date.accessioned2018-09-12T20:35:54Z
dc.date.available2018-09-12T20:35:54Z
dc.date.created2018-07-06spa
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/11349/13727
dc.descriptionPudriciones del tronco y la raíz son dos reconocidos problemas de enfermedades infecciosas en Cítricos, las cuales son causadas por la transmisión del hongo del suelo Phythopthora spp , cuando se tienen daños en el cambium y al interior de la corteza, las lesiones se pueden propagar alrededor de la circunferencia del tronco y anillar el cambium ocasionando la muerte del árbol, la copa de los arboles afectados exhiben clorosis, defoliación, muerte descendente de ramas y poco crecimiento de los brotes. Este trabajo pretende determinar el comportamiento espectral y espacial de Phytophthora spp para su detección y manejo en el cultivo de Lima Tahití a través de la evaluación de 4 escalas de severidad ( 0-sano,1-lesiones iniciales,2-lesiones ligeras,3-lesiones graves). Se seleccionó un lote de Lima Tahití con una área de 0,7 hectáreas, el cual presentaba síntomas de Phythopthora spp asociados a la pudrición del tallo, localizado en el Centro de Investigación La Libertad Corpoica Villavicencio, departamento del Meta ubicado a 04º03’N, 73º29’W y a una altitud de 336 msnm. Se realizó una evaluación de campo donde se determinó la incidencia y severidad de Phythopthora spp, posteriormente se obtuvieron imágenes multiespectrales a través de cámara MicaSense RedEdge la cual fue ubicada sobre un Multirotor hexacoptero, (vehículo aéreo no tripulado), el sensor puede captar el Rojo (R), Verde (G), azul (B), Rededge (Re), Infrarojo cercano (NIR) simultáneamente. De acuerdo al análisis espacial de Phytophthora spp realizado con la funcion vecinos más cercanos, se encuentra que la incidencia y severidad tiene un patrón disperso con una significancia de p-valor<0,05, mientras que con la función K-ripley se distribuye de forma aleatoria tanto en incidencia y severidad con una significancia de p-valor<0,01. Con la densidad de Kernel se puede observar la distribución de Phytophthora spp la cual describe patrones de propagación de la enfermedad del centro del lote hacia los costados laterales. Al analizar los perfiles espectrales con valores de reflectancia y niveles digitales, se encuentran diferencias significativas con un p-valor<0,05 entre arboles sanos y enfermos escala 3 con la banda NIR, lo cual permite la detección de Phythopthora spp, los arboles afectados muestran una coloración más oscura mientras que los sanos una coloración más brillante en diferentes combinaciones con la banda NIR, puesto que los arboles afectados muestran un mayor grado de defoliación, lo cual refleja la relación de la densidad del follaje y la respuesta del NIR. En la escala 1 no se encontraron diferencias significativas con ninguna banda, pero se pueden encontrar arboles con o sin defoliación, lo cual sugiere que hay diferentes niveles de daños internos en el cambium, ocasionando diferentes grados de defoliación, por esta razón hay árboles que pueden tener daños en el tallo pero que aún no expresan síntomas en el follaje. En la escala 2 no se encontraron árboles, en el caso de los índices de vegetación NDVI, GNDVI, SAVI y RE-NDVI se encontraron diferencias significativas con un p-valor 0,05 entre arboles sanos y escala 3, mientras que con la escala 1 no hay diferencias esto se debe al poco grado de afectación de los haces vasculares en este estado de la enfermedad. En cuanto a la clasificación con support vector machine (SVM) con los valores de niveles digitales y reflectancia de la banda NIR son bajos (60%) respecto a otros estudios realizados para otras enfermedades en cítricos como HLB (80%), ya que no hay diferencias significativas en las escalas 1 lo cual dificulta la separación entre arboles sanos y enfermos.spa
dc.description.abstractFoot and root rot are two recognized problems of infectious diseases in citrus, which are caused by the transmission of the soil fungus Phythopthora spp, when there is damage to the cambium and inside the bark, the lesions can spread around of the circumference of the trunk and ring the cambium causing the death of the tree, the canopy of the affected trees exhibit leaf yellowing, defoliation, twig dieback and short grow flushes. This work aims to determine the spectral and spatial behavior of Phytophthora spp for its detection and management in Lima Tahiti, through the evaluation of 4 severity scales (0-healthy, 1-initial lesions, 2-light lesions, 3- serious injuries). A batch of Lima Tahiti with an area of 0.7 hectares was selected, which showed symptoms of Phythopthora spp associated with foot rot, located at the La Libertad Corpoica Villavicencio Research Center, Meta department located at 04º03'N, 73º29'W and at an altitude of 336 m.a.s.l. A field evaluation was carried out where the incidence and severity of Phythopthora spp was determined, later multispectral images were obtained through MicaSense RedEdge camera which was mounted on a hexacopter multirotor, (unmanned aerial vehicle), the sensor can capture the Red (R), Green (G), blue (B), Rededge (Re), Near Infrared (NIR) simultaneously. According to the spatial analysis of Phytophthora spp performed with the nearest neighbor function, it is found that the incidence and severity have a scattered pattern with a p-value significance <0.05, whereas with the K-ripley function it is distributed from randomized in both incidence and severity with a significance of p-value <0.01. With Kernel density, the distribution of Phytophthora spp can be observed, which describes patterns of disease propagation from the center of the area to the lateral sides. When analyzing the spectral profiles with reflectance values and digital levels, significant differences are found with a p-value <0.05 between healthy and infected trees scale 3 with the NIR band, which allows the detection of Phythopthora spp, the infected trees show a darker coloration while healthy ones have a brighter coloration in different combinations with the NIR band, since the affected trees show a greater degree of defoliation, which reflects the relationship of the density of the foliage and the response of the NIR. In scale 1 no significant differences were found with any band, but you can find trees with or without defoliation, which suggests that there are different levels of internal damage in the cambium, causing different degrees of defoliation, for this reason there are trees that can have damage to the stem but still do not express symptoms in the canopy. In scale 2, no trees were found, in the case of vegetation indexes NDVI, GNDVI, SAVI and RE-NDVI significant differences were found with a p-value of 0.05 between healthy trees and scale 3, while with the scale 1 There are no differences, this is due to the low degree of involvement of the vascular bundles in this stage of the disease. Regarding the classification with support vector machine (SVM) with the values of digital levels and reflectance of the NIR band are low (60%) with respect to other studies carried out for other diseases in citrus such as HLB (80%), since There are significant differences in scales 1, which makes separation between healthy and infected trees difficult.spa
dc.description.sponsorshipCorpoicaspa
dc.format.mimetypepdfspa
dc.language.isospaspa
dc.rightsAtribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/*
dc.subjectPhythopthora sppspa
dc.subjectIncidenciaspa
dc.subjectSeveridadspa
dc.subjectDispersiónspa
dc.subjectNIRspa
dc.subjectIndices Espectralesspa
dc.titleComportamiento espectral y espacial de lima tahiti (citrus latifolia tanaka) afectada por phytophthora spp en Corpoica La Libertad-Metaspa
dc.subject.lembESPECIALIZACIÓN EN SISTEMAS DE INFORMACIÓN GEOGRÁFICA - TESIS Y DISERTACIONES ACADÉMICASspa
dc.subject.lembPATOLOGÍA VEGETAL - PROCESAMIENTO DE DATOSspa
dc.subject.lembSISTEMAS DE INFORMACIÓN GEOGRÁFICAspa
dc.subject.lembÁRBOLES FRUTALES - ENFERMEDADES - PROCESAMIENTO DE DATOSspa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.title.titleenglishSpectral and spatial behavior of lima tahiti (citrus latifolia tanaka) affected by phytophthora spp in Corpoica La Libertad-Metaspa
dc.subject.keywordPhythopthora sppspa
dc.subject.keywordIncidencespa
dc.subject.keywordSeverityspa
dc.subject.keywordDispersedspa
dc.subject.keywordNIRspa
dc.subject.keywordSpectral Indexesspa
dc.type.degreeInvestigación-Innovaciónspa
dc.rights.accesoAbierto (Texto Completo)spa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisspa
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fspa


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional
Except where otherwise noted, this item's license is described as Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional