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Title: Los Códigos de Barra de ADN como Herramienta en la Identificación de las Especies del Género Micropholis (Griseb.) Pierre (SAPOTACEAE)
Author: Sánchez Callejas, Shirley Dayana
Advisor: Cortés Ballén, Rocío
Richardson, James
Subjects: MAESTRIA EN MANEJO, USO Y CONSERVACIÓN DEL BOSQUE - TESIS Y DISERTACIONES ACADÉMICAS
HUELLAS DE PLANTAS POR ADN
BOSQUES HÚMEDOS
TAXONOMÍA VEGETAL
Keywords: Biodiversidad
Distancia Genética
ITS2
MatK
Taxonomía
RbcL
Date: 20-Oct-2016
Abstract: The genus Micropholis (Sapotaceae) is diverse and ecologically important in lowland tropical wet neotropical forests. In general, species are difficult to identify in the absence of reproductive traits and in juvenile stages. As a result we may underestimate the biodiversity of the forests where these species grow that is an impediment to forest management and conservation decision making. Alternative techniques to identify species are based on molecular characters using DNA barcoding. This study assessed the ability of molecular markers ITS2, matK and rbcL in differentiating species of the genus Micropholis. Neighbor-Joining analysis, maximum parsimony and Bayesian inference showed that ITS2 was the best marker for species identification with an efficiency of 70% in discriminating species, with sufficient interspecific and intraspecific divergence to identify 15 of the 20 species used in the analysis. The two additional chloroplast markers did not improve species determination. Thus, we propose ITS2 as a potential barcode marker for identifying species in Micropholis.
Description: El género Micropholis (Sapotaceae) es diverso y ecológicamente importante en los bosques húmedos de tierras bajas del Neotrópico. En general, las especies son difíciles de identificar en ausencia de caracteres reproductivos y en estados juveniles. Por consiguiente, se podría subestimar la biodiversidad de los bosques donde crecen, lo que a su vez podría impedir tomar decisiones acertadas en cuanto al manejo, uso y conservación de estos bosques. Actualmente, existen técnicas alternativas que permiten identificar las especies con base en caracteres moleculares usando los códigos de barra de ADN. Nuestro objetivo fue evaluar la capacidad de los marcadores moleculares ITS2, matK y rbcL en la identificación de 22 especies de Micropholis que tienen una distribución pantropical. Los análisis de Neighbor-Joining, máxima parsimonia e inferencia bayesiana mostraron que el marcador molecular con mejores resultados fue ITS2, con un 70% de eficiencia, en donde 15 de las 20 especies se pudieron identificar con esta región nuclear. Los dos marcadores del cloroplasto no presentaron resultados óptimos para la determinación de las especies del género, por lo que se propone a ITS2 como potencial código de barras para la identificación de las especies de Micropholis.
URI: http://hdl.handle.net/11349/4135
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